Program Studi S2 Teknologi Industri Pertanian menawarkan 2 (dua) minat studi, yaitu Teknologi Manajemen Agroindustri dan Teknologi Rekayasa dan Sistem Industri Manufaktur yang di dalamnya memuat 5 (lima) bidang keahlian, yaitu :
- Manajemen Industri
- Rekayasa Agroindustri Manufaktur
- Sistem Mutu dan Standardisasi
- Sistem Agroindustri Manufaktur
- Logistik dan Rantai Pasok Bahan Pangan
Lama pendidikan di Program Studi S2 Teknologi Industri Pertanian adalah 24 (dua puluh empat) bulan efektif dengan beban studi 41-44 SKS yang terdiri dari 33-36 SKS perkuliahan, dilengkapi dengan kunjungan industri, diskusi, seminar, dan lain-lain serta 8 SKS Tugas Akhir (Thesis).
Kegiatan akademik dibagi menjadi beberapa semester, yaitu :
- Matrikulasi, ditujukan bagi calon mahasiswa yang tidak mempunyai latar belakang pendidikan Teknologi Industri Pertanian minimal. Kegiatan ini bisa dilaksanakan paralel dengan pelaksanaan kuliah semester I.
- Perkuliahan dan Praktikum dalam Semester I – III.
- Penyusunan thesis dalam Semester IV.